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Papers with Code · CC BY-SA 4.0

Protein Function Prediction

32 평가 기록 7 datasets

For GO terms prediction, given the specific function prediction instruction and a protein sequence, models characterize the protein functions using the GO terms presented in three different domains (cellular component, biological process, and molecular function).

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벤치마크

Papers with Code 아카이브의 데이터셋별 기록 예시입니다. 평가 조건과 지표 방향이 검증되지 않아 순위를 의미하지 않습니다.

Dataset기록된 모델 예시MetricPaperCode
ParaSurf
AUC-PR: 0.781AUC-ROC: 0.967
논문 코드
GAL 120B
ROUGE-L: 0.252
논문 코드
ParaSurf
AUC-PR: 0.733AUC-ROC: 0.955
논문 코드
GAL 120B
ROUGE-L: 0.272
논문 코드
GAL 120B
ROUGE-L: 0.252
논문 코드
XBCR-net (ACNN)
Accuracy (5-fold): 80.4%Recall (5-fold): 71.0%Precision (5-fold): 80.1%Selectivity (5-fold): 87.9%
논문 코드
ParaSurf
AUC-PR: 0.793AUC-ROC: 0.967
논문 코드

데이터셋

7개
MIPECASPSimSeqPECANPaenSeqUniProtSeqAntibody sequences against Sars-Cov-2 and Omicron BA.1Paragraph Expanded

논문

라이브러리

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github.com/paperswithcode/galai 1 논문

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AB Antibody-antigen binding prediction 4 데이터셋 · 17 rows