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Papers with Code · CC BY-SA 4.0

PDBBind

아카이브 평가 14건 · 마지막 적재/변경 2026-10-30

원본 데이터셋 링크 1

평가 기록

과거 수집 기록이며 최신 순위가 아닙니다. 데이터셋 버전·split·실험 조건과 지표 방향이 검증되지 않은 결과는 직접 비교할 수 없습니다. 날짜는 논문 날짜이며 최신 평가일을 뜻하지 않습니다.

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원본 기록 순서 · 순위 미부여
모델	원본 지표·값	논문	구현
FABind+	Top-1 RMSD (%<2) 43.5	FABind+: Enhancing Molecular Docking through Improved Pocket Prediction and Pose Generation 2024-03-29	코드 1
DIFFDOCK (40)	Top-1 RMSD (%<2) 38.2±1.0 Top-1 RMSD (Med.) 3.30±0.11	DiffDock: Diffusion Steps, Twists, and Turns for Molecular Docking 2022-10-04	코드 1 · 코드 2
DIFFDOCK (10)	Top-1 RMSD (%<2) 35.0±1.4 Top-1 RMSD (Med.) 3.56±0.05	DiffDock: Diffusion Steps, Twists, and Turns for Molecular Docking 2022-10-04	코드 1 · 코드 2
FABind	Top-1 RMSD (%<2) 33.1	FABind: Fast and Accurate Protein-Ligand Binding 2023-10-10	코드 1
EQUIBIND+GNINA	Top-1 RMSD (%<2) 28.8	DiffDock: Diffusion Steps, Twists, and Turns for Molecular Docking 2022-10-04	코드 1 · 코드 2
EQUIBIND+SMINA	Top-1 RMSD (%<2) 23.2 Top-1 RMSD (Med.) 6.5	EquiBind: Geometric Deep Learning for Drug Binding Structure Prediction 2022-02-07	코드 1
GNINA	Top-1 RMSD (%<2) 22.9 Top-1 RMSD (Med.) 7.7	DiffDock: Diffusion Steps, Twists, and Turns for Molecular Docking 2022-10-04	코드 1 · 코드 2
GLIDE	Top-1 RMSD (%<2) 21.8 Top-1 RMSD (Med.) 9.3	DiffDock: Diffusion Steps, Twists, and Turns for Molecular Docking 2022-10-04	코드 1 · 코드 2
QVINAW	Top-1 RMSD (%<2) 20.9	DiffDock: Diffusion Steps, Twists, and Turns for Molecular Docking 2022-10-04	코드 1 · 코드 2
P2RANK+SMINA	Top-1 RMSD (%<2) 20.4 Top-1 RMSD (Med.) 6.9	DiffDock: Diffusion Steps, Twists, and Turns for Molecular Docking 2022-10-04	코드 1 · 코드 2
SMINA	Top-1 RMSD (%<2) 18.7 Top-1 RMSD (Med.) 7.1	DiffDock: Diffusion Steps, Twists, and Turns for Molecular Docking 2022-10-04	코드 1 · 코드 2
EQUIBIND	Top-1 RMSD (%<2) 5.5 Top-1 RMSD (Med.) 6.2	EquiBind: Geometric Deep Learning for Drug Binding Structure Prediction 2022-02-07	코드 1
TANKBIND	Top-1 RMSD (Med.) 4.0	DiffDock: Diffusion Steps, Twists, and Turns for Molecular Docking 2022-10-04	코드 1 · 코드 2
P2RANK+GNINA	Top-1 RMSD (Med.) 5.5	DiffDock: Diffusion Steps, Twists, and Turns for Molecular Docking 2022-10-04	코드 1 · 코드 2